Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQM1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQM1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQM1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQM1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQM1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQM1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQM1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CQM1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms