Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rwdd1Q9CQK7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd1Q9CQK7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms