Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nudt21Q9CQF3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudt21Q9CQF3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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