Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ergic3Q9CQE7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms