Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQC3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQC3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQC3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQC3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CQC3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQC3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQC3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CQC3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms