Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
1700029P11RikQ9CQ68 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
1700029P11RikQ9CQ68 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms