Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921530L21RikQ9CQ47 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms