Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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