Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ska1Q9CPV1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ska1Q9CPV1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms