Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt88Q9CPR6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt88Q9CPR6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms