Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bcl11bQ99PV8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bcl11bQ99PV8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms