Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gtf2a1Q99PM3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms