Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Bco2Q99NF1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bco2Q99NF1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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