Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rims1Q99NE5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rims1Q99NE5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rims1Q99NE5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms