Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Acss1Q99NB1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acss1Q99NB1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms