Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Mrpl43Q99N89 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Mrpl43Q99N89 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Mrpl43Q99N89 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Mrpl43Q99N89 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Mrpl43Q99N89 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Mrpl43Q99N89 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Mrpl43Q99N89 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl43Q99N89 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms