Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gdpd3Q99LY2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms