Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Sh3bp5lQ99LH9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Sh3bp5lQ99LH9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Sh3bp5lQ99LH9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp5lQ99LH9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Sh3bp5lQ99LH9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Sh3bp5lQ99LH9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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Sh3bp5lQ99LH9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Sh3bp5lQ99LH9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Sh3bp5lQ99LH9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp5lQ99LH9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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