Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TriobpQ99KW3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TriobpQ99KW3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms