Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf19Q99KP6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf19Q99KP6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms