Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clint1Q99KN9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clint1Q99KN9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms