Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab28Q99KL7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab28Q99KL7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rab28Q99KL7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rab28Q99KL7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rab28Q99KL7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rab28Q99KL7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rab28Q99KL7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rab28Q99KL7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rab28Q99KL7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rab28Q99KL7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab28Q99KL7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Rab28Q99KL7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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