Protein–RNA interactions for Protein: Q99KI3

Emc3, ER membrane protein complex subunit 3, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emc3Q99KI3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Emc3Q99KI3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms