Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lims1Q99JW4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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