Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krcc1Q99JT5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Krcc1Q99JT5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms