Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdelr1Q99JH8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdelr1Q99JH8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms