Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pacsin3Q99JB8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms