Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Def8Q99J78 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Def8Q99J78 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms