Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf112Q96DY5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms