Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Trim59Q922Y2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim59Q922Y2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms