Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Clip1Q922J3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clip1Q922J3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms