Protein–RNA interactions for Protein: Q921W0

Chmp1a, Charged multivesicular body protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1aQ921W0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chmp1aQ921W0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms