Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Sh3bp4Q921I6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Sh3bp4Q921I6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Sh3bp4Q921I6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Sh3bp4Q921I6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp4Q921I6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Sh3bp4Q921I6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sh3bp4Q921I6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sh3bp4Q921I6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sh3bp4Q921I6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sh3bp4Q921I6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Sh3bp4Q921I6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp4Q921I6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms