Protein–RNA interactions for Protein: Q91YW3

Dnajc3, DnaJ homolog subfamily C member 3, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc3Q91YW3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajc3Q91YW3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dnajc3Q91YW3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms