Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx4Q91YJ2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx4Q91YJ2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms