Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trpm2Q91YD4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trpm2Q91YD4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms