Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Basp1Q91XV3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms