Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Creb3l3Q91XE9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms