Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Ccdc7a-202ENSMUST00000108747 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chrna2Q91X60 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Chrna2Q91X60 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms