Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klc3Q91W40 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klc3Q91W40 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms