Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp3Q91W36 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp3Q91W36 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms