Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Odf4Q8VI88 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Odf4Q8VI88 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms