Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk4Q8VEJ3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk4Q8VEJ3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms