Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc71Q8VEG0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc71Q8VEG0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms