Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM1

Zgpat, Zinc finger CCCH-type with G patch domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZgpatQ8VDM1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZgpatQ8VDM1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZgpatQ8VDM1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms