Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD33

Sgtb, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgtbQ8VD33 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SgtbQ8VD33 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SgtbQ8VD33 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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SgtbQ8VD33 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgtbQ8VD33 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms