Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam20bQ8VCS3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms