Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tubg2Q8VCK3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tubg2Q8VCK3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms