Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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