Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8VCE4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8VCE4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms